随着互联网的快速发展，工作自动化的改进。在医药MES系统中RRID技术有着至关重要的作用，有助于对物品的数字化管理。对于医药MES系统中最重要的部分，食品药品安全管理，医药MES系统结合相应的后台数据信息系统，实现了对物品的准确定位与跟踪，达到过程中食品药品的安全生产管理目的。
在医药MES系统实施过程中，有两种方法可实现对整个食品药品供应链的信息跟踪：一种方法是自上游向下游的跟踪，称为追踪(Tracking或 Trace Forward)，主要用于查找造成质量问题的原因，确定产品的原产地和特征;另一种方法是自下游向上游回朔，称为追溯(Tracing或 Trace Back)，即消费者从销售环节发现购买的食品药品有安全问题，可以层层向上追溯，最终确定问题所在，主要用于问题产品的召回。
将RFID技术应用于食品药品安全管理，首先要建立完整、准确的食品药品供应链信息记录，即对食品药品供应链全过程中的产品及其属性信息、参与方信息等进行有效的标识和记录。在食品药品供应链中的每一个加工点，不仅要对自己加工的产品进行标识，还要采集所加工的食品药品原料上已有的标识信息，并将其全部信息标识在成品上，以备下一个加工者或消费者使用。
在食品药品的生产阶段，生产者把产品的名称、品种、产地、批次、生产者信息及其他必要内容存储在RFID标签中，对初始产品的信息和生产过程进行记录。
在加工阶段，利用RFID标签中的信息对产品进行分拣，符合加工条件的产品才允许进入下一个加工环节。对进入加工环节的产品，利用RFID标签中记录的信息，对不同的产品进行有针对性的处理。加工完成后，把加工者信息、加工方法、加工日期、产品等级、保质期、存储条件等内容添加到标签中。在运输和仓储阶段，利用RFID标签和沿途安装的固定读写器跟踪运输车辆的运行路线和运行时间。在仓库进I：3、出口安装固定读写器，自动记录产品的进、出库;利用标签中记录的信息，可帮助判断产品适合存储的时间;在出库时，根据存储时间选择优先出库的产品;还可以实现快速盘点，帮助管理人员随时了解库存状况。
在销售阶段，商家或医院利用RFID标签了解购人产品的状况，对产品实行准入管理。结账时，利用RFID标签可实现快速结账。商家或医院可以把本企业名称、销售时间、销售人员等信息写入标签中，在顾客退货和商品召回时对商品进行确认。
由于产品生产、加工、运输、存储、销售等环节的信息都存于RFID标签中，当产品出现问题时，可以追溯全过程，从而确定出现问题的环节和问题产品的范围。消费者也能利用RFID标签，确认购买的产品是否存在问题、是否在召回的范围。
此外，在把信息加入RFID标签的同时，可以把信息传送到公共数据库中，消费者或购买单位可以将标签的内容和数据库中的记录进行对比，从而有效地识别假冒产品。
由此，RFID技术的应用可以完成食品药品基于覆盖供应链。
全流程的数据记录和数据与物体之间的可靠联系，可确保食品药品来源淆晰，并可追溯到原材料产地，以及生产、加工、物流过程等所有环节。
对于医药MES系统从根本上实现了药品安全管理目标，将食品药品安全“源头”追溯和食品药品供应链透明化管理。同时，为了满足食品药品监管部门的工作要求，由政府牵头，建设食品药品监管平台，实现供应链各环节关联企业和部门的信息接入和共享，实现从生产源头到销售的端到端监管。
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